Abstract： 目的:探讨经导向鞘引导的超声支气管镜(EBUS-GS)联合宏基因组二代测序(mNGS)对难治性肺炎病原体的诊断价值。方法:回顾性分析2021年1月至2022年1月浙江省兰溪市人民医院经EBUS-GS联合mNGS检测的100例难治性肺炎患者的临床资料。分析EBUS-GS联合mNGS与常规培养和涂片检查对病原体的诊断价值。采用SPSS 26.0软件对数据进行分析。结果:53例患者经常规培养和涂片检查病原体为阳性，75例患者经mNGS检测病原体为阳性，两种方法的病原体阳性率差异具有统计学意义( P<0.01)。两种方法均阳性53例，均阴性为25例，结果一致为62例，不一致38例。mNGS检测混合感染25例。30例患者更改抗感染方案后获得明显疗效。所有患者采用EBUS-GS均取材成功，EBUS-GS引起少量出血8例，无气胸、大咯血等并发症发生。 结论:EBUS-GS联合mNGS对于难治性肺炎病原体诊断价值高，可诊断出混合感染，安全性较好。