You Position: Home > Paper
Identification and analysis of rat homologous gene to human HBV pre-S1 protein-binding protein
( views:113, downloads:1 )
- Author:
- No author available
- Journal Title:
- WORLD CHINESE JOURNAL OF DIGESTOLOGY
- Issue:
- 7
- DOI:
- 10.3969/j.issn.1009-3079.2004.07.014
- Key Word:
- No keyword available
Abstract： 目的:利用生物信息学(bioinformatics)技术克隆,鉴定人HBsAg前-S1蛋白结合蛋白(PSlBP)编码基因的同源基因.方法:人PSlBP由表达型cDNA文库的噬菌体展示技术筛选获得.以人的PSlBP的cDNA序列作为参照,对于美国国立卫生研究院(NIH)国立医学图书馆(NLM)生物工程信息学研究中心(NCBI)建立的核苷酸序列数据库GenBank,利用同源基因序列比对的在线分析软件BLASn进行同源基因序列的比对,发现新的来源于大鼠的同源基因.确定大鼠PSlBP的cDNA序列之后,对于大鼠PSlBP蛋白质一级结构序列与人和小鼠的PSlBP蛋白质一级结构序列的同源性进行分析.利用在线分析软件,对于大鼠PSlBP一级结构序列中潜在的修饰和功能位点进行初步的预测分析.结果:利用噬菌体展示技术获得了人的PSlBP的cDNA序列.以生物信息学技术确定了大鼠PSlBP的cDNA其编码产物的序列.大鼠PSlBP的cDNA由1 455 nt组成,编码产物由484aa组成.大鼠PS1BP蛋白质一级结构与人和小鼠PS1BP蛋白质一级结构的同源性分别为80.79%(391/484)和92.98%(450/484).利用在线分析软件,在大鼠PSlBP蛋白质一级结构中还发现了一系列潜在的蛋白质修饰结构位点.结论:大鼠PSlBP基因及其编码产物序列被确定.
- [1]成军,夏小兵,王刚,等.杜氏利什曼原虫激活蛋白激酶C受体的基因克隆化与序列分析[J].2002,(2).
- [2]巨立中,钟彦伟,成军,等.应用噬菌体展示技术筛选丙型肝炎病毒核心蛋白反式激活基因HCTP4启动子DNA的结合蛋白[J].2003,(6).
- [3]李克,王琳,成军,等.酵母双杂交技术筛选克隆丙型肝炎病毒NS3结合蛋白基因[J].2003,(1).
- [4]王琳,李克,成军,等.丙型肝炎病毒非结构蛋白5A反式激活基因11的克隆化研究[J].2003,(3).
- [5]杨倩,董菁,成军,等.乙型肝炎病毒基因组中前-X-编码基因启动子序列的确定及转录活性的鉴定[J].2003,(9).
- [6]成军.功能基因组学与肝脏疾病研究[J].2004,(1).
- [7]陆荫英,李克,王琳,等.乙型肝炎病毒前S2蛋白结合蛋白基因的筛选[J].2003,(1).
- [8]王琳,李克,成军,等.酵母双杂交技术筛选Hcbp6结合的肝细胞蛋白编码基因[J].2003,(4).
- [9]成军.病毒性肝炎发病机制相关基因克隆化的研究策略[J].2003,(9).
- [10]成军,董菁,洪源,等.乙型肝炎病毒中国流行株全基因的克隆与序列分析[J].2003,(8).
- [11]杨艳杰,成军,陈东风,等.应用噬菌体展示技术筛选乙型肝炎病毒表面抗原基因启动子Ⅱ结合蛋白[J].2004,(1).
- [12]钟彦伟,成军,焦成松,等.抗丙型肝炎病毒核心蛋白单链抗体的制备及免疫组织化学研究[J].2004,(1).
- [13]陆荫英,陈天艳,成军,等.乙型肝炎病毒前-S2蛋白结合蛋白基因S2-29的克隆化研究[J].2003,(8).
- [14]KE Li,Lin WANG,Jun CHENG,etc.Interaction between hepatitis C virus core protein and translin protein- a possible molecular mechanism for hepatocellular carcinoma and lymphoma caused by hepatitis C virus[J].2003,(2).
- [15]成军.新基因结构与功能研究的策略[J].2003,(4).
- [16]成军,钟彦伟,刘妍,等.利什曼原虫无鞭毛体蛋白的基因克隆化与序列分析[J].2001,(1).
- [17]成军,李克,王琳,等.丙型肝炎病毒非结构蛋白5A结合蛋白37小鼠同源基因的克隆化及结构分析[J].2004,(2).
- [18]李克,王琳,成军,等.丙型肝炎病毒核心蛋白与转位蛋白相互作用的研究[J].2002,(10).
- [19]钟彦伟,成军,陈新华,等.应用噬菌体表面展示技术筛选丙型肝炎病毒NS5A抗原模拟表位[J].2002,(2).
- [20]巨立中,钟彦伟,成军.应用噬菌体展示技术筛选丙型肝炎病毒非结构蛋白NS5A反式激活基因NS5A-TP9启动子DNA的结合蛋白[J].2003,(6).
- [21]成军,董菁.乙型肝炎病毒基因组结构与功能复杂性的认识[J].2003,(8).
- [22]杨倩,董菁,成军,等.乙型肝炎病毒基因组中前-前-S-编码基因启动子序列的确定及转录活性的鉴定[J].2003,(9).
- [23]王琳,李克,成军,等.筛选与克隆肝再生增强因子结合蛋白的基因[J].2002,(2).
- [24]成军.噬菌体表面展示技术的新发展及在病毒性肝炎研究中的应用[J].2004,(1).
- [25]董菁,成军.乙型肝炎病毒基因组中前-前-S区编码基因的界定[J].2003,(8).
- [26]钟彦伟,成军,张忠东,等.应用噬菌体展示技术筛选丙型肝炎病毒非结构蛋白NS4A结合蛋白[J].2004,(1).
- [27]董菁,王业东,成军,等.噬菌体表面展示技术筛选乙型肝炎病毒前S1蛋白结合蛋白基因[J].2004,(1).
- [28]刘妍,成军,王琳,等.羧基末端截短型乙型肝炎病毒表面抗原中蛋白反式激活基因1的克隆化研究[J].2003,(8).
- [29]杨倩,刘妍,成军,等.丙型肝炎病毒非结构蛋白5A反式激活基因4的克隆化研究[J].2003,(3).
- [30]钟彦伟,成军,蔡炯,等.丙型肝炎病毒包膜蛋白E2抗独特型人源单链可变区抗体的筛选与鉴定[J].2002,(8).
- [31]Yan-Wei Zhong,Jun CHENG,Gang Wang,etc.Preparation of human single chain Fv antibody against hepatitis C virus E2 protein and its identification in immunohistochemistry[J].2002,(5).
- [32]成军.坚持相对稳定的科研方向是关键[J].2003,(12).
- [33]董菁,施双双,张国庆,等.HBsAg与抗-HBs同时阳性者体内S基因序列分析[J].2002,(5).
- [34]成军,李莉.清除乙型肝炎病毒的非细胞裂解机制[J].2002,(1).
- [35]成军,李克,王琳,等.牛丙型肝炎病毒核心蛋白结合蛋白6同源基因的克隆化研究[J].2003,(5).
- [36]成军.肝炎病毒蛋白对肝细胞基因组转录调节及信号转导机制的影响[J].2004,(2).
- [37]成军,钟彦伟,刘妍.人肝再生增强因子基因组DNA的克隆化与序列分析[J].2000,(1).
- [38]成军,李克,陆荫英,等.丙型肝炎病毒核心蛋白结合蛋白6基因和蛋白的生物信息学分析[J].2003,(4).
- [39]董菁,成军,皇甫竞坤,等.慢性乙型肝炎患者体内乙型肝炎病毒DNA序列异质性及准种特点的研究[J].2002,(2).
- [40]董菁,施双双,王业东,等.cDNA文库噬菌体展示法的建立及乙型肝炎病毒前S1蛋白结合蛋白筛检[J].2002,(4).
- [41]成军.肝炎病毒与肝细胞相互作用的分子生物学机制研究策略[J].2003,(6).
- [42]李克,王琳,成军,等.酵母双杂交技术筛选克隆HCV核心蛋白结合蛋白基因1[J].2001,(12).
- [43]王琳,李克,成军,等.筛选与克隆丙型肝炎病毒NS5A蛋白结合蛋白的基因[J].2003,(1).
- [44]陆荫英,李克,成军,等.乙型肝炎病毒X基因酵母表达载体构建及表达[J].2002,(1).
- [45]王刚,刘妍,牟劲松,等.大鼠肝再生相关基因LRRP1的克隆化[J].2002,(2).
- [46]董菁,成军.乙型肝炎病毒基因组中前-X编码基因的界定[J].2003,(8).
- [47]张忠东,成军,钟彦伟,等.应用噬菌体展示技术筛选乙型肝炎病毒核心启动子结合蛋白[J].2004,(1).
- [48]成军,钟彦伟,刘妍,等.墨西哥利什曼原虫无鞭毛体蛋白的基因克隆化与序列分析[J].2000,(2).