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Change of gene expression profile and its significance in mouse with oxygen-induced retinopathy

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Author:
No author available
Journal Title:
CHINESE JOURNAL OF PERINATAL MEDICINE
Issue:
6
DOI:
10.3760/cma.j.issn.1007-9408.2006.06.008
Key Word:
寡核苷酸序列分析;视网膜病,早产儿;基因表达谱;小鼠

Abstract: 目的 应用基因芯片技术研究早产儿视网膜病(retinopathy of prematurity,ROP)基因表达谱的变化规律及意义.方法 7日龄C57BL/6J新生小鼠暴露于75%的高氧5 d后回到空气中,制成ROP动物模型,应用Trizol法抽提17日龄小鼠ROP模型及同时期对照组小鼠的视网膜总RNA,逆转录并用Cy3和Cy5标记,与小鼠Oligo表达谱芯片杂交,扫描后获取基因表达信息,进行差异分析、聚类分析和基因分类等生物信息学分析.结果 与正常小鼠比较,视网膜病变小鼠有1347个基因呈差异表达.SOM聚类显示12类不同的表达差异变化模式,基因本体学分析显示变化的基因并不局限于血管生成相关因子,发育相关基因及G蛋白信号通路相关基因改变亦很明显(P<0.05).结论 ROP小鼠视网膜基因表达谱有较大改变,为今后从分子生物学角度探索该病发病机制和进行基因治疗奠定基础.

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