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One plasmid standard for detecting both bcr-abl P210 and abl gene cDNA in real-time quantitative RT-PCR

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Author:
No author available
Journal Title:
JOURNAL OF LEUKEMIA & LYMPHOMA
Issue:
3
DOI:
10.3760/cma.j.issn.1009-9921.2007.03.001
Key Word:
基因,bcr-abl;实时定量PCR;质粒;白血病,髓样,慢性;Taqman探针

Abstract: 目的 建立一个荧光实时定量PCR(RQ-PCR)共用质粒标准品,用于同时检测bcr-abl P210白血病融合基因和abl内参基因.方法 分离K562细胞RNA,反转录为cDNA,以此为模板,设计引物进行PCR,PCR产物经琼脂糖电泳、胶回收,T-A载体克隆后,转化JM109工程菌,抽提质粒、测序、测定拷贝/μl,冻存备用.以RQ-PCR和定性巢式PCR进行验证,检测23例CML患者的骨髓标本,并同bcr-abl基因荧光原位杂交(FISH)结果比较.结果 获得了预期的模板质粒,以欧洲抗癌协会推荐的引物探针RQ-PCR检测bcr-abl P210和abl基因,浓度相同时,Ct值相同;反复检测日内差和日间差均<5%.23例标本按FISH结果≥10%(n=8)、0.5%~10%(n=6)和阴性(n=9)分组,RQ-PCR结果分为0.492±0.263、0.023±0.033和(4.33±3.84)×10;FISH阴性组和其余两组间P值均<0.001,三组间P值均<0.05.结论 该研究建立了bcr-abl P210基因和abl基因共用的质粒标准品,定量准确,性质稳定,能简化操作,满足临床检测和科研的要求.

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