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Evaluation of the mycobacterial interspersed repetitive units typing as a practical approach in molecular epidemiology of Mycobacterium tuberculosis

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Author:
No author available
Journal Title:
CHINESE JOURNAL OF TUBERCULOSIS AND RESPIRATORY DISEASES
Issue:
5
DOI:
10.3760/j:issn:1001-0939.2005.05.002
Key Word:
分枝杆菌,结核;基因型;串联重复序列

Abstract: 目的建立结核分枝杆菌散在分布重复单位 (mycobacterial interspersed repetitive units,MIRU)基因型分型法,评估该方法在我国应用的可行性.方法采用简单数字表法随机抽取上海地区2000年至2002年保存的菌株,对其进行MIRU分型,并与间隔区寡核苷酸分型法(Spoligotyping)的结果进行比较.结果用Spoligotyping方法对随机抽样的91株临床菌株进行基因型分型,得到20种基因型,其中81株(89%)属于北京基因型菌株,而用MIRU分型方法可将这些菌株分为46种基因型.81株北京基因型菌株可以分为39种不同的MIRU基因型.12个MIRU位点的多态性分析表明各位点有较大的区别,其中位点26显示了较高的多态性,位点16、31、40显示了中等程度的多态性.结论 MIRU分型方法简单快速,其数字化结果清晰可靠,是一种有效的结核分枝杆菌基因型分型方法.

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