Abstract: 功能性肠病是一种常见的胃肠道疾病综合症,其特征是在没有已知器质性病变的情况下,肠道运动和分泌功能失调,但功能性肠病的发病机制尚不明确。近年来,随着神经胃肠病学的发展,初步表明其发生和脑-肠轴关系密切。经颅磁刺激是一种非侵入性无痛性的神经系统检测和治疗技术,通过脑-肠轴能够起到调整功能性肠病的作用,为功能性肠病的治疗提供了新的方向。本文通过文献检索的方法,总结分析了近年来国内外学者使用经颅磁刺激疗法应用于肠易激综合征和功能性便秘患者的研究进展,发现经颅磁刺激疗法可以改善功能性肠病患者的肠道不适以及伴随的精神症状。