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Electronic cloning and functional prediction of a novel gene RBAG2-3 associated with experimental brain abscess
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- Author:
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- Journal Title:
- CHINESE JOURNAL OF NEUROMEDICINE
- Issue:
- 2
- DOI:
- 10.3760/cma.j.issn.1671-8925.2006.02.002
- Key Word:
- 实验性脑脓肿;生物信息学;电子克隆;新基因
Abstract： 目的研究脑脓肿形成和发展过程中所涉及的新分子.方法对应用mRNA荧光差异显示技术(DD-PCR)获得的脑脓肿早期差异表达cDNA片段G2-3进行电子克隆,根据电子克隆的结果设计引物进行逆转录-多聚酶链式反应(RT-PCR)、克隆及测序,验证电子克隆的准确性,并利用生物信息学技术对电子克隆产物进行功能预测.结果G2-3经电子克隆获得长度为1 157 bp的新基因RBAG2-3,Genbank登陆号为CN382815.结构功能分析显示RBAG2-3编码73个氨基酸残基的蛋白,存在多个功能作用位点,并具有PSI和H-NS结构功能域.结论经电子克隆获得新基因RBAG2-3,其编码蛋白具有多个功能作用位点,并具有能对神经上皮组织基因表达起作用的结构功能域,可能在脑脓肿的发病中起重要作用.
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