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Molecular signature analysis of heavy chain CDR residues in human anti-gp120 antibodies
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- Author:
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- Journal Title:
- JOURNAL OF THE FOURTH MILITARY MEDICAL UNIVERSITY
- Issue:
- 1
- DOI:
- 10.3321/j.issn:1000-2790.2005.01.002
- Key Word:
- gp120;抗体;CDR;多序列比较
Abstract： 目的:分析gp120表面不同抗原决定簇诱导产生的人抗体重链可变区序列,探讨各类抗体胚系基因家族利用率、CDRs残基利用率及平均pI值与其空间结构和生物学功能的关系. 方法:收集人抗gp120抗体重链可变区序列,按照序列的标注将其分至不同表位组并建立相关数据库. 将其与Kabat数据库中的所有人源抗体进行比较,统计不同表位组抗gp120抗体的家族利用率、残基利用率以及不同位点的平均pI值的差别,并用SWISS-MODEL工具进行结构验证. 结果:人抗gp120抗体中VH1家族利用率最高,约占49%,较普通人群的22%显著增高. 各表位组间的残基利用差别主要集中于CDR2区,且以CD4i组与V3组间的残基利用率差异最为显著. 结论:人抗gp120抗体一级序列所蕴含信息的不同,直接决定了其三级结构和生物功能的差异. 这些序列差异的发现,将为以后通过抗体改造提高该类抗体特异性和亲和力提供一定的参考信息.
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