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Bioinformatic analysis of ndrg2 and NDRG2 protein

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Author:
No author available
Journal Title:
JOURNAL OF THE FOURTH MILITARY MEDICAL UNIVERSITY
Issue:
17
DOI:
10.3321/j.issn:1000-2790.2003.17.001
Key Word:
ndrg2基因;NDRG2蛋白;生物信息学分析;α/β水解酶

Abstract: 目的:对ndrg2( n-myc downsream regulator gene 2)基因调控区和NDRG2蛋白序列进行生物信息学分析,从结构上预测其功能. 方法:运用internet网络上的数据库及程序,对ndrg2基因的调控区和NDRG2蛋白的二级结构进行生物信息学分析. 结果:ndrg2基因调控区存在多种转录因子结合位点,功能主要涉及组织特异性表达调控,细胞生长发育相关基因和应激反应基因的表达调控等;NDRG2蛋白的结构属于α/β水解酶类折叠,其分类预测表明与细菌环氧化物水解酶的二级结构极为相似. 结论:生物信息学分析提示NDRG2蛋白具有一定的酶活性,可能参与细胞抗氧化应激反应,内外源有毒物质的代谢,维持细胞内氧还电势平衡等.

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